MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017783	A	6	6	5	10	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017783	AT	3	6	37	42	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017783	ATT	2	6	69	74	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017783	TAA	2	6	78	83	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017783	CTAAAT	2	12	105	116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017783	ACA	2	6	149	154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017783	AT	3	6	276	281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017783	A	7	7	288	294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017783	AAT	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017783	AAG	2	6	338	343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017783	AGT	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017783	TAT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017783	CAT	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017783	ATT	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017783	AAAGAC	2	12	431	442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017783	A	6	6	465	470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017783	ATA	2	6	488	493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017783	AATA	2	8	495	502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017783	TAAA	2	8	503	510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017783	ATTG	2	8	549	556	25 %	50 %	25 %	0 %	386858679
21	NC_017783	TAT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
22	NC_017783	TGT	3	9	851	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
23	NC_017783	AAC	2	6	860	865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858679
24	NC_017783	CTA	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858679
25	NC_017783	TAA	2	6	937	942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858679
26	NC_017783	TTA	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
27	NC_017783	TGT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
28	NC_017783	TA	3	6	1113	1118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017783	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017783	TTATT	2	10	1173	1182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017783	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017783	CTA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017783	TAA	2	6	1222	1227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017783	AATATT	2	12	1235	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017783	TA	3	6	1434	1439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017783	A	9	9	1448	1456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017783	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017783	GCA	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017783	ATA	3	9	1477	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017783	ATA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017783	CTA	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017783	ATC	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858680
43	NC_017783	AAAAC	2	10	1589	1598	80 %	0 %	0 %	20 %	386858680
44	NC_017783	T	8	8	1613	1620	0 %	100 %	0 %	0 %	386858680
45	NC_017783	T	6	6	1687	1692	0 %	100 %	0 %	0 %	386858680
46	NC_017783	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
47	NC_017783	CTT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858680
48	NC_017783	CAA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858680
49	NC_017783	AAT	2	6	1803	1808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
50	NC_017783	CCAT	2	8	1868	1875	25 %	25 %	0 %	50 %	386858680
51	NC_017783	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	386858680
52	NC_017783	ATTT	2	8	2050	2057	25 %	75 %	0 %	0 %	386858680
53	NC_017783	TAA	2	6	2091	2096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017783	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017783	AACTT	2	10	2118	2127	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017783	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858681
57	NC_017783	TA	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	386858681
58	NC_017783	TCTT	2	8	2212	2219	0 %	75 %	0 %	25 %	386858681
59	NC_017783	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858681
60	NC_017783	T	6	6	2293	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	386858681
61	NC_017783	TAT	2	6	2330	2335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
62	NC_017783	A	7	7	2359	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	386858681
63	NC_017783	A	6	6	2394	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	386858681
64	NC_017783	TAA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
65	NC_017783	CTG	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858681
66	NC_017783	TAA	2	6	2465	2470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
67	NC_017783	ATGT	2	8	2600	2607	25 %	50 %	25 %	0 %	386858681
68	NC_017783	AT	4	8	2694	2701	50 %	50 %	0 %	0 %	386858681
69	NC_017783	ATCA	2	8	2778	2785	50 %	25 %	0 %	25 %	386858681
70	NC_017783	ATA	2	6	2807	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
71	NC_017783	ACC	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858681
72	NC_017783	TTA	2	6	2873	2878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
73	NC_017783	T	7	7	2885	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	386858681
74	NC_017783	AATC	2	8	2906	2913	50 %	25 %	0 %	25 %	386858682
75	NC_017783	T	7	7	2927	2933	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
76	NC_017783	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
77	NC_017783	CTTT	2	8	3009	3016	0 %	75 %	0 %	25 %	386858682
78	NC_017783	T	7	7	3014	3020	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
79	NC_017783	A	6	6	3049	3054	100 %	0 %	0 %	0 %	386858682
80	NC_017783	TTA	2	6	3063	3068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
81	NC_017783	TA	3	6	3080	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	386858682
82	NC_017783	T	6	6	3147	3152	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
83	NC_017783	CTT	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858682
84	NC_017783	AAT	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
85	NC_017783	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	386858682
86	NC_017783	TTA	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
87	NC_017783	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858682
88	NC_017783	ATAA	2	8	3363	3370	75 %	25 %	0 %	0 %	386858682
89	NC_017783	TAA	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
90	NC_017783	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
91	NC_017783	T	8	8	3428	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
92	NC_017783	AC	3	6	3451	3456	50 %	0 %	0 %	50 %	386858682
93	NC_017783	CAA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858683
94	NC_017783	T	6	6	3484	3489	0 %	100 %	0 %	0 %	386858683
95	NC_017783	CTC	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
96	NC_017783	TAA	2	6	3543	3548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
97	NC_017783	ATT	2	6	3554	3559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858683
98	NC_017783	AAT	2	6	3598	3603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
99	NC_017783	TTC	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
100	NC_017783	AT	3	6	3670	3675	50 %	50 %	0 %	0 %	386858683
101	NC_017783	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858683
102	NC_017783	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
103	NC_017783	T	6	6	3710	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	386858683
104	NC_017783	TATT	2	8	3768	3775	25 %	75 %	0 %	0 %	386858683
105	NC_017783	CT	3	6	3777	3782	0 %	50 %	0 %	50 %	386858683
106	NC_017783	CCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
107	NC_017783	TCTAT	2	10	3951	3960	20 %	60 %	0 %	20 %	386858683
108	NC_017783	TCT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
109	NC_017783	TTC	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
110	NC_017783	TGT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858683
111	NC_017783	AG	3	6	4028	4033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017783	ATC	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017783	T	6	6	4059	4064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017783	T	6	6	4099	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017783	TTTTC	2	10	4109	4118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017783	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017783	TAT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017783	ATT	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017783	T	6	6	4183	4188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017783	GAT	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017783	TCTT	2	8	4217	4224	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017783	T	6	6	4226	4231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017783	T	7	7	4267	4273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017783	N	910	910	4305	5214	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017783	TATT	2	8	5217	5224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017783	T	8	8	5232	5239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017783	AT	4	8	5367	5374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017783	TAT	2	6	5399	5404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017783	TAA	2	6	5429	5434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017783	A	7	7	5441	5447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017783	CAA	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017783	TTA	2	6	5478	5483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017783	T	6	6	5495	5500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017783	ATA	3	9	5520	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017783	GTAA	2	8	5540	5547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017783	ATTT	2	8	5549	5556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017783	TAA	2	6	5557	5562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017783	ATT	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017783	A	6	6	5613	5618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017783	ACA	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017783	ATG	3	9	5713	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
142	NC_017783	TAA	2	6	5742	5747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
143	NC_017783	TAG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
144	NC_017783	T	6	6	5881	5886	0 %	100 %	0 %	0 %	386858684
145	NC_017783	TAT	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
146	NC_017783	GTT	3	9	5950	5958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858684
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.